Сложно посоветовать не зная технические возможности Вашего станка. На изделии видны поднутрения, на пяти координатном станке такое сделать не проблема. Но мне кажется что у Вас классические три оси.  Фреза не сможет залезть внутрь заготовки для выборки среднего паза. Значит нужно разделять заготовку на несколько плоскостей и обрабатывать их отдельно с последующей склейкой. И полбеды если модель только в плоскости X-Y, но здесь она меняется ещё и по Z - её часть поднимается (опускается) над плоскостью, значить разделение заготовки нужно увеличивать на неопределенно большое количество частей уже по координате Z и опять же обрабатывать их по отдельности, скорее всего с переворачивание элементов для избегания тех самых поднутрений.
В общем задача решаема, но учитывая время на создание модели, фрезеровкой с учетом выставления и крепления всех элементов на столе - дешевле сделать руками.
Как вариант - использовать поворотную ось, но тут по Z нужно иметь неплохой запас.
Ну а если у Вас все эти вопросы решены и действительно осталась проблема с углом стыковочных концов, то можно использовать функцию "создание наклонной плоскости" в вкладке "операции с рельефом". Там необходимо указать координаты точек создаваемой плоскости, которую нужно расположить на этих концах модели. Зная необходимый угол и расстояние между точками можно вычислить все координаты плоскости. Здесь поможет предмет геометрия.

Ну например: создаёте необходимую наклонную плоскость методом выдавливание в операциях с рельефом

На получившуюся плоскость загружаете имеющийся слой модели

Но по-моему подобное лучше делается в другой программе типа 3D-Max либо подобной.

В Rino такие вещи очень легко получаются, и мануал к нему очень понятный.