На Шпинделях(фрез.моторах)цанги затягиваются до конца.По нижним точкам цанг все шпиндели устанавливаются на одной высоте.Назовём это юстировкой шпиделей.После юстировки шпинделей одинаковые фрезы вставляются с одинаковым вылетом.Удобно это делать калибром,один конец упирается в цангу,второй конец удерживает фрезу на калиброванном расстоянии.Гайка при этом затянута настолько чтобы фрезу ещё можно передвигать.После установки длины затягивают гайку цанги.Опытные операторы вместо калибра успешно используют штангенциркуль.Дотягивание гайки не приводит к сильным смещениям,к тому же,если предположить большое смещение,то смещение будет одинаковым на всех шпинделях.Ноль по Z можно устанавливать по одному шпинделю.На многих фирмах в Германии,Австрии,Швецарии,Чехии,Голландии  применяют этот метод не один десяток лет.Цанги,например, ER16.

Не вижу ничего сложного. По заготовке для каждого конкретного шпинделя.