Первый вариант.
Сохраните модель в СТЛ-формате, нажав кнопку "Создать сетку", а затем произвести обычное открывание этой СТЛ-модели с коррекцией высоты внедрения модели (если возможно такое небольшое, но всё-таки отрезание нижней части).
Второй вариант.
1 Постройте границу рельефа (кнопка "создать векторную границу рельефа"), где в выпадающем меню установить границу построения чуть выше помех на модели.
2 Сделайте внешний вектор всех границ активными на 2D-виде.
3. Удалите вектора внешних границ.
4 сделайте все вектора внутренних границ активными на 2D-виде.
5. Для красоты залейте выделенные вектора  цветом.
6. Обнулите либо по кнопке обнуления внутри векторов или по кнопке обнуления по цвету.
Таким способом можно вырезать по подбираемой высоте часть  нужную часть рельефа, а всё ненужное обнулять. Далее эту нужную часть в "чистом" виде можно использовать для стыковки или внедрения в новой модели.